La Ciudad Académica, una ciudad oculta en Tokyo con una población 2.3 millones donde 1.8 millones son estudiantes, la ciudad está lleno de robots y maquinas de alta tecnología y una fuerte mediadas de seguridad. Esto es porque la ciudad en si es un gigantesco laboratorio que someter a sus estudiantes a experimentos para desarrollar poderes paranormales, segun sus poderes se califican de nivel 0 a 5. Mikoto Misaka "Railgun" es una de los 7 nivel 5 de la ciudad y junto con Shirai Kuroko que pasan sus dias haciendo cosas normales de adolecentes y peleando contra delicuentes que abusan de sus poderes para cometer crimenes.
